Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col19a1Q0VF58 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col19a1Q0VF58 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms