Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt80Q0VBK2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt80Q0VBK2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms