Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prelid2Q0VBB0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prelid2Q0VBB0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prelid2Q0VBB0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms