Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5bQ0V8T8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms