Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cntnap5cQ0V8T7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms