Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Vps8Q0P5W1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Vps8Q0P5W1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms