Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gcnt1Q09324 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gcnt1Q09324 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms