Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms