Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gata4Q08369 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms