Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tgm3Q08189 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms