Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms