Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp2Q06649 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp2Q06649 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms