Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cab39Q06138 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms