Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fmn1Q05860 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Fmn1Q05860 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms