Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms