Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smpd1Q04519 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smpd1Q04519 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms