Protein–RNA interactions for Protein: Q03288

Asip, Agouti-signaling protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AsipQ03288 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AsipQ03288 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AsipQ03288 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AsipQ03288 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AsipQ03288 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AsipQ03288 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AsipQ03288 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AsipQ03288 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AsipQ03288 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AsipQ03288 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AsipQ03288 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AsipQ03288 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AsipQ03288 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AsipQ03288 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AsipQ03288 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AsipQ03288 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AsipQ03288 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms