Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd1Q02242 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pdcd1Q02242 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms