Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2cQ01098 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms