Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb2Q00977 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms