Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
AlkP97793 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
AlkP97793 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
AlkP97793 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
AlkP97793 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
AlkP97793 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
AlkP97793 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
AlkP97793 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
AlkP97793 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
AlkP97793 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
AlkP97793 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
AlkP97793 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
AlkP97793 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
AlkP97793 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
AlkP97793 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
AlkP97793 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
AlkP97793 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AlkP97793 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AlkP97793 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AlkP97793 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
AlkP97793 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AlkP97793 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AlkP97793 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AlkP97793 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AlkP97793 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AlkP97793 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
AlkP97793 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AlkP97793 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
AlkP97793 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AlkP97793 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AlkP97793 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
AlkP97793 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AlkP97793 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AlkP97793 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AlkP97793 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
AlkP97793 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
AlkP97793 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
AlkP97793 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
AlkP97793 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
AlkP97793 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
AlkP97793 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
AlkP97793 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
AlkP97793 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
AlkP97793 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
AlkP97793 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
AlkP97793 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
AlkP97793 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
AlkP97793 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
AlkP97793 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
AlkP97793 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
AlkP97793 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
AlkP97793 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
AlkP97793 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
AlkP97793 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
AlkP97793 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
AlkP97793 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
AlkP97793 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
AlkP97793 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
AlkP97793 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AlkP97793 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AlkP97793 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AlkP97793 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AlkP97793 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
AlkP97793 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
AlkP97793 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
AlkP97793 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AlkP97793 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AlkP97793 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
AlkP97793 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
AlkP97793 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
AlkP97793 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
AlkP97793 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
AlkP97793 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
AlkP97793 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
AlkP97793 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
AlkP97793 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
AlkP97793 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
AlkP97793 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
AlkP97793 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
AlkP97793 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AlkP97793 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AlkP97793 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
AlkP97793 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AlkP97793 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
AlkP97793 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AlkP97793 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AlkP97793 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
AlkP97793 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
AlkP97793 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
AlkP97793 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
AlkP97793 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
AlkP97793 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
AlkP97793 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
AlkP97793 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
AlkP97793 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
AlkP97793 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
AlkP97793 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
AlkP97793 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
AlkP97793 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
AlkP97793 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms