Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nbr1P97432 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms