Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b3P97370 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b3P97370 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b3P97370 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1b3P97370 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1b3P97370 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1b3P97370 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1b3P97370 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b3P97370 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b3P97370 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b3P97370 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms