Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms