Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct7P80313 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct7P80313 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct7P80313 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct7P80313 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct7P80313 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct7P80313 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct7P80313 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct7P80313 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct7P80313 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct7P80313 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct7P80313 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cct7P80313 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cct7P80313 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cct7P80313 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cct7P80313 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms