Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otx2P80206 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Otx2P80206 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Otx2P80206 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Otx2P80206 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Otx2P80206 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Otx2P80206 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Otx2P80206 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Otx2P80206 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Otx2P80206 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Otx2P80206 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Otx2P80206 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx2P80206 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx2P80206 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms