Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf3P70671 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf3P70671 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf3P70671 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf3P70671 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf3P70671 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf3P70671 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf3P70671 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf3P70671 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf3P70671 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf3P70671 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf3P70671 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf3P70671 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf3P70671 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms