Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aup1P70295 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aup1P70295 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aup1P70295 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aup1P70295 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Aup1P70295 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Aup1P70295 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Aup1P70295 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Aup1P70295 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Aup1P70295 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Aup1P70295 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Aup1P70295 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aup1P70295 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Aup1P70295 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Aup1P70295 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms