Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgif1P70284 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgif1P70284 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms