Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sycp3P70281 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms