Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf5P70191 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf5P70191 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf5P70191 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf5P70191 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf5P70191 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf5P70191 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf5P70191 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf5P70191 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf5P70191 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Traf5P70191 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf5P70191 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf5P70191 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf5P70191 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms