Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps17P63276 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps17P63276 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps17P63276 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps17P63276 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps17P63276 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps17P63276 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps17P63276 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps17P63276 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps17P63276 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps17P63276 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps17P63276 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps17P63276 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms