Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms