Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ElobP62869 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ElobP62869 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ElobP62869 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ElobP62869 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ElobP62869 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ElobP62869 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ElobP62869 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ElobP62869 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ElobP62869 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ElobP62869 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ElobP62869 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ElobP62869 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ElobP62869 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ElobP62869 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ElobP62869 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ElobP62869 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ElobP62869 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ElobP62869 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ElobP62869 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ElobP62869 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ElobP62869 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ElobP62869 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ElobP62869 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ElobP62869 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ElobP62869 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ElobP62869 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ElobP62869 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ElobP62869 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ElobP62869 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ElobP62869 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ElobP62869 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ElobP62869 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ElobP62869 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ElobP62869 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ElobP62869 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ElobP62869 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ElobP62869 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ElobP62869 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ElobP62869 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ElobP62869 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ElobP62869 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ElobP62869 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ElobP62869 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ElobP62869 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ElobP62869 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ElobP62869 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ElobP62869 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ElobP62869 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ElobP62869 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ElobP62869 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ElobP62869 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ElobP62869 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ElobP62869 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ElobP62869 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ElobP62869 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ElobP62869 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ElobP62869 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ElobP62869 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ElobP62869 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ElobP62869 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ElobP62869 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ElobP62869 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ElobP62869 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ElobP62869 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms