Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vsnl1P62761 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vsnl1P62761 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vsnl1P62761 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vsnl1P62761 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vsnl1P62761 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vsnl1P62761 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vsnl1P62761 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vsnl1P62761 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vsnl1P62761 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vsnl1P62761 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vsnl1P62761 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsnl1P62761 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms