Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpcal1P62748 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpcal1P62748 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpcal1P62748 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpcal1P62748 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpcal1P62748 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpcal1P62748 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpcal1P62748 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpcal1P62748 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpcal1P62748 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpcal1P62748 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpcal1P62748 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hpcal1P62748 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms