Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps13P62301 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps13P62301 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps13P62301 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps13P62301 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps13P62301 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps13P62301 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms