Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc1P62192 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc1P62192 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc1P62192 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms