Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vbp1P61759 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms