Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme3P61290 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme3P61290 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme3P61290 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme3P61290 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme3P61290 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme3P61290 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme3P61290 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme3P61290 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme3P61290 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms