Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b6P59708 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms