Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scarf2P59222 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf2P59222 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms