Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Paxbp1P58501 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Paxbp1P58501 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxbp1P58501 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paxbp1P58501 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms