Protein–RNA interactions for Protein: P56844

Tcl1b4, Protein TCL1B4, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcl1b4P56844 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b4P56844 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b4P56844 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcl1b4P56844 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms