Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SmoP56726 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SmoP56726 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SmoP56726 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SmoP56726 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmoP56726 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SmoP56726 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SmoP56726 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SmoP56726 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SmoP56726 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SmoP56726 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SmoP56726 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SmoP56726 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SmoP56726 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SmoP56726 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SmoP56726 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SmoP56726 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SmoP56726 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SmoP56726 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SmoP56726 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmoP56726 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmoP56726 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmoP56726 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmoP56726 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SmoP56726 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmoP56726 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmoP56726 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmoP56726 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmoP56726 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmoP56726 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmoP56726 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmoP56726 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmoP56726 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmoP56726 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmoP56726 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmoP56726 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmoP56726 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmoP56726 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmoP56726 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SmoP56726 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SmoP56726 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SmoP56726 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SmoP56726 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SmoP56726 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SmoP56726 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SmoP56726 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SmoP56726 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SmoP56726 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SmoP56726 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmoP56726 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SmoP56726 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SmoP56726 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SmoP56726 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SmoP56726 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SmoP56726 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SmoP56726 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SmoP56726 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SmoP56726 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SmoP56726 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SmoP56726 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SmoP56726 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SmoP56726 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SmoP56726 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SmoP56726 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SmoP56726 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SmoP56726 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SmoP56726 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SmoP56726 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmoP56726 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmoP56726 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmoP56726 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmoP56726 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmoP56726 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmoP56726 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmoP56726 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmoP56726 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmoP56726 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SmoP56726 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms