Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5bP56480 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5bP56480 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5bP56480 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5bP56480 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5bP56480 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5bP56480 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5bP56480 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5bP56480 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp5bP56480 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms