Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab2aP53994 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms