Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fdft1P53798 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fdft1P53798 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms