Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2e3P52483 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms