Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XpcP51612 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XpcP51612 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
XpcP51612 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XpcP51612 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
XpcP51612 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
XpcP51612 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XpcP51612 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XpcP51612 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
XpcP51612 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XpcP51612 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XpcP51612 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XpcP51612 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XpcP51612 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XpcP51612 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XpcP51612 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XpcP51612 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XpcP51612 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XpcP51612 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XpcP51612 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XpcP51612 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XpcP51612 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XpcP51612 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XpcP51612 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XpcP51612 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XpcP51612 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XpcP51612 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XpcP51612 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XpcP51612 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XpcP51612 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XpcP51612 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XpcP51612 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XpcP51612 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XpcP51612 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XpcP51612 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XpcP51612 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XpcP51612 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XpcP51612 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XpcP51612 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XpcP51612 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XpcP51612 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XpcP51612 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XpcP51612 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XpcP51612 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XpcP51612 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XpcP51612 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
XpcP51612 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XpcP51612 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XpcP51612 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XpcP51612 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XpcP51612 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
XpcP51612 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XpcP51612 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XpcP51612 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XpcP51612 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XpcP51612 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XpcP51612 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XpcP51612 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XpcP51612 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XpcP51612 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
XpcP51612 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XpcP51612 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XpcP51612 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XpcP51612 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XpcP51612 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XpcP51612 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XpcP51612 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XpcP51612 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XpcP51612 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XpcP51612 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
XpcP51612 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
XpcP51612 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XpcP51612 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XpcP51612 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
XpcP51612 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XpcP51612 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XpcP51612 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XpcP51612 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XpcP51612 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XpcP51612 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XpcP51612 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XpcP51612 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XpcP51612 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XpcP51612 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XpcP51612 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XpcP51612 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XpcP51612 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XpcP51612 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XpcP51612 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XpcP51612 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XpcP51612 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XpcP51612 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XpcP51612 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XpcP51612 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XpcP51612 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XpcP51612 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XpcP51612 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XpcP51612 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XpcP51612 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
XpcP51612 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms